一、浸洗法：此法是指一定容器內，配製高濃度的藥物，用較短的時間，浸洗魚體，從而達到殺滅魚類身體或鰓上病原體的目的。使用這種方法，若是寄生蟲病，往往浸洗一次至兩次即可奏效。若是傳染性魚病，需要浸洗多次方能徹底治癒，且第二次浸洗與第一次中間應隔1—2天。
　　具體方法是計算好容器中的水體積後，一次放入所需藥量，待藥液充分溶解後將藥液攪勻，然後將病魚放入藥液中，浸洗時間長短，主要根據水溫高低或魚體耐藥程度而定。在藥物安全的範圍內，浸洗時間越長，效果越明顯。在浸洗過程中，如發現金魚忍受不了藥物的刺激，應立即將魚放入事先準備好的清水中，沖洗十分鐘，以洗去魚體和鍶上粘附的藥液。
　　需要注意的是浸洗的藥物應現配現用，一次配好，可浸洗十批魚體，每一批數量不宜過多，以金魚不浮頭為原則。而且此法只適用於全長1.5厘米以上的小魚和大魚，同時要對原養殖水體進行徹底消毒，對於全長不足尺寸的魚苗，只能應用全池遍灑法。
　　二、遍灑法：使用這種方法治療寄生蟲性魚病，通常潑灑一次即可奏效。而傳染性魚病，則需經5—10天，再用一次或兩次藥方可。具體方法為：首先正確測量水缸或魚池的面積和水深，計算體積後計算用藥量，然後稱取藥物溶解、稀釋後均勻潑灑到水體中，需要注意的是：由於有些藥物濃度依水溫高低而定，所以必須在放藥前先測量水溫。另外，小水體採用遍灑法一定要事先減少金魚的密度，以保證藥後在3—5天內不換水而金魚也不浮頭為原則。
　　三、內服法：此法是將藥物拌和在金魚的飼料中投喂，主要防治體內疾病。口服藥餌的製法將內服藥如夫喃西林、夫喃唑酮、磺胺塞唑等拌和麵粉，加入少量魚蟲干，再加入適量的清水，拌勻後，壓成細麵條，干後弄碎，每天投喂一次，連續投喂3—6天。
　　四、注射法：此法主要防治一些傳染性魚病，分為腹腔注射和肌肉注射兩種。腹腔注射是將針頭沿腹鰭基部插入，注射深度為0.2—0.5厘米，以不傷及內臟為準。較大的魚體才可在肌肉部位注射，通常是背鰭基部的無鱗區。注射法只限於全長6.6厘米以上的魚體。
　　五、塗抹法：此法主要用於外傷或局部炎症的防治。通常用高濃度藥物塗抹傷處或病灶。棉球或毛筆蘸取藥液塗抹，為避免藥液流到鰓上，要交魚頭朝上，尾向下，從前往後塗抹。多次塗抹時，每次塗抹時間應間隔一天。