微生物是一類我們看不見的生物，在我們的生活中它無處不在，比如細菌、真菌、寄生蟲等等，在觀賞魚的飼養環境中它也大量的存在，所以如果你的觀賞魚生病了，可能是沒有注意周圍環境微生物的緣故。
首先在養殖水方面必須保證有良好的水質，由於秋季是魚類生長的旺季，大量餵食，排泌物相對增多，非常容易造成水質的變壞（懸浮粒子增加，水體混濁，氨氮、亞硝酸鹽增加）。因此要求多排底水，勤於換水。購買新魚時要注意觀察魚的狀態，盡可能購進健康的魚。同時做好轉水同溫的工作。
一年內曾經進魚的，有必要在開春和初秋做一次全池（全缸）殺蟲殺菌預防工作。近來購進或準備購進的新魚必須做好檢疫工作，有條件的隔離暫養20-30日，並同時進行常規的殺蟲殺菌。
魚虱也是微生物的一種，它附著於魚體表面，吸食魚的血液。傷口常造成其他細菌類或真菌類的感染。五六個魚虱會在十來分鐘咬死一尾15cm長的健康鯽魚。危害不可謂不大。如果觀賞魚感染了魚虱，在魚體上寄生的蟲體不多的情況下可以用鑷子直接拔除。如果感染嚴重，那就需要用百萬分之零點三至零點五（0.3-0.5ppm）的敵百蟲溶液藥浴。蟲體會被麻痺並且脫落掉入水底。然後將魚撈回原缸。並且在原缸內用敵百蟲溶液遍撒。另外病魚還可用百萬分之五到八的高錳酸鉀溶液清洗。
觀賞魚的養殖中要注意病源微生物
微生物的防治可分為以下幾個步驟：
一、消毒
消毒是為了破壞引發疾病的第一要素。消毒的目的是為了降低病原體數量，減少發病率。消毒大概分：開缸消毒、日常護理消毒、病魚消毒、創傷消毒。
二、提高魚身體素質
這是為了破壞引發疾病的第三要素。提高魚的免疫力。主要方式有二：均衡營養和良好舒適的環境。魚的抗病能力必然增強。
三、定期投喂抗菌素藥餌
屬於預防性用藥，可加強魚的抗病能力。屬於第三要素，降低易感性。但是有弊病，容易造成耐藥性。
四、病魚的抗菌素治療
屬於後補加強抵抗力。嚴格意義來講，不屬於第三要素。屬於補救做法。
養殖觀賞魚需要有科學的方法，對於養殖的環境也需要我們用心去保持，保證了觀賞魚環境的衛生，防治了微生物的病害，才能使觀賞魚更加完美地成長。
