挑選種兔要耐心細緻，凡是不符合本品種外貌特徵的，一定不能做種用。有各種生理缺陷或畸形的，不管是先天性的還是後天性的，同樣都不能做種用。常見的畸形有如下幾種：

　　一、門齒過長 也叫下頜顎突畸形。有的家免下門齒向斜上方長出，像倒長的象牙，而上門齒卻向嘴裡長，變得長而彎曲，就像羊犄角一樣，嚴重影響家兔採食，採食長草更加困難，還容易刺破上顎和齒齦。

　　二、八字腿 兩隻腿向斜前方伸出，呈八字形，邁步較困難。八字腿有先天性的，也有後天性的。先天性的會遺傳，後天性的是由於營養不良（鈣、磷比例不合適）、管理不當（自幼生活在過於光滑的底網上，身體重心變位，造成腿骨骼畸形）等造成的。不管是先天性的還是後天性的，都不能做種用。

　　三、垂尻 有的家兔尻部太斜，配種很不方便，而且外形也不美觀，不宜留做種用。

　　四、垂耳 少數品種的兔耳朵是下垂的，這是本品種固有的特徵，如法國垂耳兔、英國垂耳兔、荷蘭垂耳兔，但就多數品種而言，家兔的兩耳是直立的，由於遺傳或後天原因，出現了一個或兩個耳下垂，這就屬於缺陷，不宜做種用。

　　另外，公兔隱睪、單睪或小睪丸，陰部畸形公母難分，母兔乳頭過少等，均不宜留做種用。